Bhutan heeft drie klimaatgebieden. In het noorden, dat grenst aan China en in de Himalaya ligt, heerst een hooggebergteklimaat. Het is er droog en uiteraard koud. In de Himalayadalen is het klimaat gematigd. De zomers zijn warm en de winters mild. De moessonperiode loopt van juni tot oktober. In het zuiden is het klimaat subtropisch. Het regenseizoen is hier heftig. Vooral 's nachts kan het er flink tekeer gaan. Maart en april zijn de beste maanden om een bezoek aan het land te brengen. Ook laat in de herfst, na het regenseizoen, is een goede reistijd.